rotunda,…) avec une transition du Sphagno-Pinetum vers le Sphagno-Piceetum. Actuellement la partie Est s’assèche et les espèces d’amibes à thèques plutôt xérophiles et forestières abondent (Nebela militaris, N. Les analyses effectuées ont montré que la partie Est était jadis nettement plus humide qu’actuellement et présentait des conditions proches du marais de transition (Caricetum fuscae), alors que la presqu’île a peu changé et est toujours restée typique du haut-marais oligo- et ombrotrophe (Sphagnetum magellanicii). Couplé à des analyses physico-chimiques, les amibes à thèques ont servi d’organismes bioindicateurs afin de définir les conditions actuelles et celles précédent l’intervention humaine, dans le but d’évaluer l’évolution récente de la tourbière. Le but de cette étude est de décrire les conditions écologiques actuelles, avant la restauration de la tourbière, en vue d’un suivi à long terme. Celui-ci devrait limiter voire stopper les pertes d’eau dues au drainage et redistribuer l’eau dans l’ensemble de la tourbière, redonnant une dynamique proche de celle d’une tourbière intacte. Un projet de restauration a été planifié et les travaux ont commencé à l’automne 2016. Les drains, actuellement encore présents, contribuent à l’assèchement et à l’érosion de cette zone. Enfin la partie Est fut drainée sur toute sa surface afin d’alimenter l’étang en eau. La presqu’île fut passablement épargnée par les activités humaines et est encore aujourd’hui considérée comme intacte. La partie Ouest fut exploitée pour sa tourbe puis restaurée dans les années 80. All rights reserved.Įtendue autour d’un étang artificiel créé afin de faire fonctionner un moulin vers 1650, la tourbière de la Gruère présente actuellement plusieurs visages. Thus, we suggest that the mt genome emerges as an alternative for unraveling the lower-level phylogenetic relationships of Amoebozoa. We conclude that, although most systematic work has relied on SSU, this gene alone can severely underestimate diversity. Additionally, we demonstrate that between closely related taxa, there are high levels of synteny, which can be explored for primer design to obtain larger fragments than the traditional barcoding genes. Phylogenetic reconstructions using 26 mt genes also indicate a level of divergence that is comparable to divergence among species, while reconstructions using the small subunit ribosomal DNA (SSU rDNA) do not. Morphological analyses determined that these lineages are indistinguishable from their previously sequenced counterparts. vermiformis 21.6% and 13.1% respectively), while divergence at the small subunit ribosomal DNA is below 1% within both species. castellannii 16.4% divergence at nucleotide level and 10.4% amino acid V. The newly sequenced mt genomes are significantly divergent from their previously sequenced conspecifics (A. Both have mitochondrial genomes of close relatives previously available, enabling insights into recent divergences at a genomic scale, while simultaneously offering comparisons with divergence estimates obtained from traditionally used single genes, SSU rDNA and cox1. Here, we present the complete mitochondrial genomes of two ubiquitous and abundant morpho-species (Acanthamoeba castellanii and Vermamoeba vermiformis). Hence, there is an undersampling of both genes and taxa in the group especially compared to plants, animals and fungi. The group is understudied from a systematic perspective: molecular tools have only been applied in the last 15 years. The Amoebozoa are a major eukaryotic lineage that encompasses a wide range of amoeboid organisms. rotunda (Penard 1890), describe three new species: N. collaris (Ehrenberg 1848) Kosakyan et Gomaa, change N. We redefine Nebela tincta (Leidy) Kosakyan et Lara and N. We therefore revise the taxonomy of the group. We show here that small variations in test morphology that have been often overlooked by traditional taxonomy correspond to distinct haplotypes. Our goals were (1) to clarify the taxonomy and the phylogenetic relationships within this group, and (2) to evaluate if individual genotypes corresponded to specific morphotypes and the extent of phenotypic plasticity. We examined the relationship between morphological and genetic diversity within this species complex by combined analyses of light microscopy imaging and Cytochrome Oxidase Subunit 1(COI) sequences obtained from the same individual amoeba cells. The taxonomic validity of characters used to define species within this group is debated and causes confusion in studies of biogeography, and applications in palaeoecology. Nebela tincta-collaris-bohemica (Arcellinida) is a species complex of small to medium-sized (ca.100μm) testate amoebae common in peat bogs and forest soils. Species identification by means of morphology is often problematic in protists.
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